扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，如此处长期阻塞，分泌物引流不畅，干酪样物积聚，致不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而成结石。散布于咽壁淋巴组织的结石，形小、质软、易碎，扁桃体结石则较大，坚硬如石。包埋于粘膜下的结石，表面多呈结节状。粘膜表面可因受压糜烂，发生流脓瘘管，常使扁桃体上隐窝和舌腭弓粘连。其核心可为小异物、脱落的上皮细胞或细菌等。在有纤毛菌丝的四面亦常可发生结石。
若结石周围有化脓感染，可有咽痛不适与反射性耳痛；重者感吞咽困难，言语含糊不清，口涎多，张口受限等。有感染时，常自觉口臭。有时结石可自扁桃体上陷窝或舌腭弓处破出。
扁桃体结石表现主要有几点，如：慢性扁桃体炎，慢性口臭或不适等。扁桃体结石的人经常抱怨的疼痛和不适，除了带来的扁桃体结石，更可怕的是恶臭，而且往往是造成口臭。其含有高量的磺胺类和细菌，当粉碎，生产硫酸气味臭鸡蛋。
扁桃体结石给人的感觉就是喉咙不舒服，像被什么东西堵住了一样，但由于扁桃体结石是陷入扁桃腺组织的，许多患者自行采取措施来消除扁桃体结石，包括运用各种手段，如用：棉花棒、指甲，硬抠出来。结果导致扁桃腺的软组织受伤，或不小心是的划破臭扁桃体结石。
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扁桃体结石时，一定要尽快前往专业的耳鼻喉医院进行检查和治疗，争取早日恢复健康。
